1996年，岳阳市遭受百年不遇的特大洪涝灾害。7月15～18日，全市平均降雨240毫米，多的地方达451毫米，资水、沅水流域长时间、高强度、大范围的降雨，柘溪水库、凤滩水库、五强溪水库超强度大泄洪，湘水、澧水持续上涨，加上长江水位顶托，形成洞庭湖水上压下顶，水位猛涨，22日2时，出现历史最高洪峰35.31米，超1954年最高水位0.76米。幸福垸、集成垸、钱粮湖垸等75个大小堤垸溃决，13个县（市）、区、场有215个乡镇（分场）、3339个村、333.9万人受灾，占总人口的70%以上。其中死亡66人，被洪水围困106.9万人，紧急转移89.9万人；农作物受灾面积23万公顷，其中81万多公顷绝收，减产和损失粮食67.6万吨；倒塌各种房屋23.2万多间、543万多平方米；4077家工矿企业停产半停产；一大批公路、桥涵、水库、电站等基础设施遭到严重破坏，直接经济损失达149.45亿元。省领导储波、郑培民、许云昭赶赴汛区，指导督促防汛工作。市委、市政府紧急动员，全面部署，精心调度，实行领导分片包干责任制；3800多名解放军、武警官兵在抗灾抢险中发挥了突击作用；各部门紧密配合，180万群众全力以赴，鏖战月余，力挽狂澜，最大限度地减少了灾害损失，被省委、省政府领导誉为“创造了抗洪抢险的人间奇迹”。

1998年，岳阳市又一次遭遇特大洪灾。４～９月，全市降雨量达1394.8毫米，较历年同期平均降雨量916.5毫米偏多52%。６月26日7时至29日2时，仅67小时内，城陵矶水位从31米防洪水位猛升至35.94米，分别超1996年、1954年最高水位0.63米和1.39米。６月29日至９月14日，高洪水位持续78天。在此期间，江湖洪峰叠加，长江连续出现每秒5.2万～6.36万立方米的流量，先后形成8次大洪峰。全市共发生各类险情1.2万处，其中较大险情969处。有14个县(市)、区、场252个乡镇(分场)3534个村受灾，漫溃大小巴垸47个，其中千亩以上堤垸26个，被洪水围困22.34万人，紧急转移76万人，损坏房屋22.67万间、269.17万平方米；倒塌房屋7.91万间、110.68万平方米，死亡63人，湖区受渍面积11万公顷，共减产粮食57万吨，损失粮食12.38万吨，因灾停工、停产工矿企业1129家，全市直接经济损失75亿元。中央、省部领导十分关注岳阳灾情，国务院总理朱镕基、副总理温家宝、全国政协主席李瑞环先后到岳指导抗洪抢险，省委副书记储波坐镇指挥。在严重自然灾害面前，市委、市政府全面部署，积极发动和组织群众全力以赴应对自然灾害。全市有2万多名国家干部、２万多名解放军武警官兵，共计80多万军民投入抗洪斗争。岳阳市被人事部、水利部评为全国抗洪抢险先进集体。